Функционируют две основные системы С. о. — вывозная (занято свыше тысячи спецавтомашин и механизмов) и сплавная (хоз.-бытовая и ливневая канализации). Хоз.-бытовая канализация начала действовать в 1894. Её суточная пропускная способность составляла 7 вёдер на 1 жителя, или 80 литров; протяжённость сети — 75,3 км. В 1909—12 проложен Лыбедский коллектор. Протяжённость сети возросла до 151,2 км. В 1941 она равнялась 245 км. Сейчас все стоки города проходят через Бортнические очистные сооружения. Протяжённость сети канализации составляет (1984) свыше 1,5 тыс. км, суточная пропускная способность — 400 литров на 1 жителя.